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| RUNX3 | Q13761 | Z99127.3-201 | ENST00000448158 | 395 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL158210.1-201 | ENST00000448835 | 500 nt | TSL 3 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136097.1-201 | ENST00000456945 | 913 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEACAMP4-201 | ENST00000457676 | 421 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099499.1-201 | ENST00000505040 | 558 nt | TSL 3 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSPE1P23-201 | ENST00000509838 | 286 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP82-201 | ENST00000516786 | 223 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | MYCBP2-AS1-209 | ENST00000631152 | 412 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4278-201 | ENST00000636094 | 69 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DLD-214 | ENST00000639772 | 421 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THOC2-201 | ENST00000245838 | 5609 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AKAP6-201 | ENST00000280979 | 15006 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PNISR-201 | ENST00000369239 | 5112 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ABCD2-201 | ENST00000308666 | 6238 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TTC41P-203 | ENST00000548527 | 1475 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NBPF20-201 | ENST00000369373 | 18760 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CACNB4-260 | ENST00000637762 | 3800 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PWAR6-201 | ENST00000552334 | 4618 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z98941.1-201 | ENST00000407764 | 100 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068533.2-201 | ENST00000411872 | 306 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010731.3-201 | ENST00000415029 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL158834.2-201 | ENST00000415731 | 696 nt | TSL 2 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01318-201 | ENST00000423593 | 597 nt | TSL 4 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS6P15-201 | ENST00000431996 | 751 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ENOX1-AS2-201 | ENST00000434273 | 609 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC016696.1-201 | ENST00000446949 | 318 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068580.2-201 | ENST00000449749 | 338 nt | TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MRPS31P2-201 | ENST00000451581 | 518 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099566.1-212 | ENST00000451675 | 799 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00456-201 | ENST00000453862 | 692 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL023581.2-201 | ENST00000454588 | 552 nt | TSL 2 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC067945.3-201 | ENST00000456176 | 386 nt | TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU7-170P-201 | ENST00000459303 | 61 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087879.1-201 | ENST00000474343 | 374 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL5P23-201 | ENST00000496040 | 868 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092924.1-201 | ENST00000496084 | 487 nt | TSL 4 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093292.1-201 | ENST00000505050 | 449 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087241.1-201 | ENST00000508615 | 429 nt | TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC063948.1-201 | ENST00000547360 | 379 nt | TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC117377.1-201 | ENST00000547633 | 1038 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161713.1-201 | ENST00000555538 | 145 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TGIF1P1-201 | ENST00000558095 | 802 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087465.1-201 | ENST00000560574 | 245 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087463.4-202 | ENST00000566676 | 579 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138915.2-201 | ENST00000569776 | 97 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008088.1-201 | ENST00000580993 | 280 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009271.1-202 | ENST00000588803 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BNIP3P24-201 | ENST00000593398 | 557 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008946.1-201 | ENST00000599756 | 421 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL034351.1-201 | ENST00000605288 | 668 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC097478.2-201 | ENST00000610572 | 514 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590240.3-201 | ENST00000621416 | 943 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007490.1-201 | ENST00000624321 | 703 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC244517.7-201 | ENST00000625144 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC116618.1-201 | ENST00000634617 | 774 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068620.4-201 | ENST00000636730 | 1182 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WRN-201 | ENST00000298139 | 5215 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000526.1-201 | ENST00000603308 | 1388 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CNBD1-202 | ENST00000518476 | 1594 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FILIP1L-206 | ENST00000471562 | 2854 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCDH15-208 | ENST00000395432 | 6901 nt | TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011978.2-201 | ENST00000569835 | 2054 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC10A5P1-201 | ENST00000379063 | 1306 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCNT2-202 | ENST00000367433 | 5883 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARHGAP28-202 | ENST00000314319 | 5415 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6C76-201 | ENST00000328314 | 939 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1243P-201 | ENST00000364028 | 107 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RHEBP3-201 | ENST00000411920 | 351 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO3P1-205 | ENST00000422088 | 832 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139421.1-201 | ENST00000423010 | 169 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |