Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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RUNX3Q13761 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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RUNX3Q13761 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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RUNX3Q13761 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX3Q13761 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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