Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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TUBA3CQ13748 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
TUBA3CQ13748 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TUBA3CQ13748 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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