Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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FOXE3Q13461 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXE3Q13461 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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