Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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