Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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MKRN4PQ13434 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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