Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NME3Q13232 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NME3Q13232 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NME3Q13232 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms