Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms