Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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IFT88Q13099 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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IFT88Q13099 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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IFT88Q13099 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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