Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BNIP3Q12983 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms