Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
KCNMA1Q12791 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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