Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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FOXO1Q12778 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
FOXO1Q12778 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXO1Q12778 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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