Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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CASQ1P31415 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CASQ1P31415 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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