Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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LRRTM2O43300 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
LRRTM2O43300 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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