Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SHOC2Q9UQ13 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms