Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms