Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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FOXQ1Q9C009 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXQ1Q9C009 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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