Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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CCDC47Q96A33 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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CCDC47Q96A33 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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CCDC47Q96A33 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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CCDC47Q96A33 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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CCDC47Q96A33 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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CCDC47Q96A33 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CCDC47Q96A33 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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