Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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GEN1Q17RS7 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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GEN1Q17RS7 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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GEN1Q17RS7 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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GEN1Q17RS7 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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GEN1Q17RS7 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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GEN1Q17RS7 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
GEN1Q17RS7 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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