Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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CCDC142Q17RM4 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CCDC142Q17RM4 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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