Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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RTL8BQ17RB0 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RTL8BQ17RB0 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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