Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LAMA3Q16787 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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