Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNAPC1Q16533 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms