Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms