Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms