Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC6Q16204 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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