Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHHQ15465 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHHQ15465 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHHQ15465 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHHQ15465 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHHQ15465 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHHQ15465 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHHQ15465 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHHQ15465 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SHHQ15465 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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