Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SYCP1Q15431 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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SYCP1Q15431 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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SYCP1Q15431 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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SYCP1Q15431 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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SYCP1Q15431 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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SYCP1Q15431 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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SYCP1Q15431 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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SYCP1Q15431 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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SYCP1Q15431 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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SYCP1Q15431 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SYCP1Q15431 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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