Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UBE3CQ15386 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms