Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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PTPRRQ15256 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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PTPRRQ15256 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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PTPRRQ15256 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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PTPRRQ15256 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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PTPRRQ15256 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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PTPRRQ15256 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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PTPRRQ15256 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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PTPRRQ15256 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRRQ15256 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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