Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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COL19A1Q14993 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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COL19A1Q14993 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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COL19A1Q14993 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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COL19A1Q14993 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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COL19A1Q14993 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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COL19A1Q14993 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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COL19A1Q14993 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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COL19A1Q14993 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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COL19A1Q14993 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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COL19A1Q14993 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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COL19A1Q14993 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COL19A1Q14993 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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