Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SMC1AQ14683 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMC1AQ14683 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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