Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
COL9A3Q14050 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms