Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms