Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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TCIRG1Q13488 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TCIRG1Q13488 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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