Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SF3B2Q13435 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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