Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
MKRN4PQ13434 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
MKRN4PQ13434 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms