Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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