Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PDE3BQ13370 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms