Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SP140Q13342 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SP140Q13342 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SP140Q13342 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SP140Q13342 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SP140Q13342 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SP140Q13342 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SP140Q13342 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SP140Q13342 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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SP140Q13342 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SP140Q13342 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SP140Q13342 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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