Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
IFT88Q13099 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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