Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PTPREP23469 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.32
PTPREP23469 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPREP23469 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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