Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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PTPRAP18433 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRAP18433 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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