Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms