Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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COPS7AQ9UBW8 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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COPS7AQ9UBW8 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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COPS7AQ9UBW8 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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