Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TRERF1Q96PN7 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TRERF1Q96PN7 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TRERF1Q96PN7 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TRERF1Q96PN7 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TRERF1Q96PN7 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TRERF1Q96PN7 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TRERF1Q96PN7 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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