Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SNX29Q8TEQ0 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SNX29Q8TEQ0 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms