Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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