Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTXN3Q4LDR2 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTXN3Q4LDR2 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms