Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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