Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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